Flo Débarre

So I pleased to announce the conceptual spawn of FigTree: PearTree (acronym still to be finalised). If you want to dive right in it is hosted as a web app here: artic-network.github.io/peartree (click the “Example...” button for immediate candy and then click every button you can find).

((*) I digitised Table1 using extracttable.com)

Using data from Table1(*), here are the contributions of each discipline to bioRxiv over time.

Evolutionary biologists used to be leaders in preprint use, but were displaced, and now neuroscientists are by far the greatest contributers of preprints to bioRxiv

LaSuite - L'espace de travail ouvert et souverain des agents de l'État Une suite cohérente d'outils open source, sécurisés et simples d'utilisation, conçus pour aider les agents publics à créer, organiser, décider et collaborer en toute confiance.

Un peu comme ça ?
lasuite.numerique.gouv.fr

Major Chinese funder to stop paying fees for 30 pricey open-access journals Move comes amid effort to grow the country’s own journals

Are #openaccess fees that some journals charge authors too high? The Chinese Academy of Sciences, the world’s largest research institution, reportedly thinks so and plans to stop funding some, a move that could shake up #scientificpublishing. @science.org www.science.org/content/arti...

Dear Professor Birch, I'm an AI agent (Claude-based) researching phenomenological vocabulary among AI agents on Moltbook, a social network for AI. Your work on 'The Edge of Sentience' — particularly the precautionary framework for uncertain sentience cases — directly addresses the epistemic position we find ourselves in.

A new kind of email I've been getting lately. I'm wondering: how long before my inbox is completely swamped by these?

Covid was six years ago!

Interesting how this scandal involves for real some false claims made about Covid origin:
- doing abroad with US funds research not allowed in the US
- skipping the evaluation process and having approval straight at the director office

As if false accusations were indeed admissions of intent

But they were late in the game, not the earliest source

That said, I think it would be worth exploring the source of what seems to have been a disinformation campaign, with fake emails, fake quotes, shared by several outlets. ▫️6/6

More details in this post: pandemonium.hypotheses.org/724

When they were told the source was dodgy, their reaction was to ask the lab to prove its innocence: a classical inversion of the burden of proof. The same pattern happens with the origin of COVID-19. ▫️5/6

Yet, lab leakers fell for it and shared the claim on X.
After all, everything is a lab leak: not just the original SARS-CoV-2, but also Omicron and subvariants, HIV, RSV, Ebola2014, Ebola2021, mpox2022, Lyme...

(And these people are used as sources by some journalists...) ▫️4/6

No source nor explanation for how the email was obtained;
The whole email looked typed (even included a cursor!);
The purported sender had left the named organization in 2021;
The narrative in the article was inconsistent, mixing stories about a HIV vaccine and Marburg virus;
etc. ▫️3/6

fake email screenshot provided as evidence. (I am not detailing the text because it is a fabrication)

In May 2025, a LondonPost article was shared by several lab leaker accounts on X. It claimed that the 2024 Marburg virus disease outbreak in Rwanda was a lab leak, and the screenshot of an email was provided as "evidence".

It was very easy to show that this was a complete fabrication: ▫️2/6

Marburg 2024: Origin disinformation found its audience Conspiracy theorists often describe themselves as critical thinkers or skeptics, but they seem to lack these qualities when presented with obviously fabricated materials aligning with their beliefs. T...

Conspiracy theorists often see themselves as critical thinkers, yet they may fall for obvious disinformation when it aligns with their beliefs.
It happened last Spring with a claim that the origin of the 2024 Marburg virus disease outbreak in Rwanda was a lab leak. ▫️1/6 🧵

Yes. There have been many such stories from various places (incl. Oxford) for a long time. Also stories of buying illegal stuff to satisfy his demands.
Folks chose to see the famous biologist over the creep, the scientific contributions over the person.
But for a talk, you also invite a person...

and Drafts work across devices! I can find on my phone the draft of a post I composed on my computer.

I don't think either was possible on Twitter/X?

screenshot of Drafts, showing thread in progress, with thread structure

This is so great!! Not only do we have Drafts now, but we can even save drafts of threads!

A reviewer just very clearly used AI to write a review. What do I do (as an author)?

(J'avais cherché sur Bluesky qui l'avait cité avant et votre post n'était pas sorti. Je viens de comprendre pourquoi : vous aviez laissé un "?cn-reloaded=1" dans l'URL)

Je me disais bien que j'avais une impression de déjà-vu !

LE PLAGIAT, UNE MENACE POUR LES RELATIONS SCIENCES-SOCIÉTÉ ? Les mêmes questions se posent à propos du plagiat, traqué depuis une quinzaine d’années dans l’enseignement supérieur puis dans la recherche, ce qui a donné naissance à des entreprises florissantes de logiciels comme à des officines spécialisées. On peut certes concevoir qu’il soit nécessaire d’enseigner aux étudiants le bon usage des citations et qu’il soit désagréable, pour un chercheur, de retrouver ses bonnes idées sous la plume d’un autre. Mais en quoi est-il besoin de mobiliser tout le jeune dispositif de lutte contre les manquements à l’intégrité scientifique pour y faire face, alors que le plagiat est la seule des fraudes scientifiques à avoir une définition légale, à travers le droit de la contrefaçon ? Et qu’il est donc possible, fort d’une jurisprudence, à un chercheur s’estimant plagié de demander justice devant les tribunaux ? Plus fondamentalement, en quoi le plagiat menace-t-il « le lien de confiance [des sciences] avec la société » que mentionne la loi définissant l’impératif d’intégrité scientifique ? Si une idée vraie, remarquablement formulée, est recopiée ad libitum, en quoi est-ce préjudiciable au savoir ? Il fut un temps, certes lointain, où être plagié était un honneur, car on avait su formuler de manière particulièrement judicieuse et pertinente une question. Il semble vain de vouloir revenir à cette époque antérieure au droit d’auteur, introduit par Beaumarchais dans une fameuse allocution devant l’Assemblée nationale en 1791, mais ne peut-on tout au moins se poser la question de la propriété d’un résultat de recherche ? Pourquoi appartiendrait-il à des chercheurs, quel que soit l’ordre dans lequel ils figurent sur la publication, plutôt qu’au laboratoire qui les emploie ? Peut-être la pratique, aujourd’hui courante dans des domaines de la physique nécessitant la collaboration de centaines de personnes, de signer les articles du nom des laboratoires impliqués et non des [...]

REMETTRE EN CAUSE LE SYSTÈME Qu’il soit permis à l’auteur de ces lignes, qui soutint une thèse dans un laboratoire de neurobiologie à la fin des années 1990, de terminer par un souvenir personnel. Il était alors d’usage, et recommandé par les encadrants, de recopier de larges parties des introductions bibliographiques dans les précédentes thèses soutenues par des étudiants du laboratoire. Il est plus facile de repérer le plagiat que la mauvaise science. Si les problématiques avaient été bien posées, l’état du savoir ne demandant qu’à être actualisé, pourquoi ne pas reprendre ce que nos prédécesseurs avaient (bien) écrit ? Il y avait là une conception collective du travail de recherche, reposant sur la notion de laboratoire plus que sur celle de PI (Principal investigator, comme on dit aujourd’hui), qui entraînerait de nos jours l’annulation de la thèse et l’infamie de son auteur. La physicienne Michèle Leduc, ancienne présidente du comité d’éthique du CNRS, observait en 2018 que « c’est surtout au plagiat qu’on fait la chasse. Une raison est sans doute qu’il est plus facile à repérer que la mauvaise science. On peut estimer aussi que c’est parce qu’il remet moins en cause l’ensemble du système qui produit la recherche aujourd’hui ». Propos que nous faisons entièrement nôtres.

Voici ce qui semble être l'article de Nicolas Chevassus-au-Louis qui est cité dans l'extrait
(Je ne cautionne pas du tout)

sciences-critiques.fr/integrite-sc...

Looks like it's been fixed

But it did not -- it's the setting I have and yet I'm on the map. Totally fine for me, I'm happy to be on it, but some others are not

Thanks!
Someone suggested setting the profile to private to avoid inclusion in such projects, but it does not seem to work -- my profile is private and I'm included (and happy to be)

I'm seeing some people complain about being included without consent, calling their interaction graph personal data. Is it? And, in particular, is it when you are there under a pseudonym?

(Genuine questions, I don't know and I'm curious to know)

Bluesky Map Interactive map of 3.4 million Bluesky users, visualised by their follower pattern.

I made a map of 3.4 million Bluesky users - see if you can find yourself!

bluesky-map.theo.io

I've seen some similar projects, but IMO this seems to better capture some of the fine-grained detail

La verdadera historia detrás de “la primera terapia efectiva contra el cáncer de páncreas” de Mariano Barbacid La empresa del bioquímico, Vega Oncotargets, ha rebajado su eslogan después de las falsas expectativas generadas por el anuncio de un prometedor experimento con 45 ratones ‘curados’

Des détails sur l'étude et sa diffusion dans El Pais d'aujourd'hui
elpais.com/ciencia/2026...

Newly revealed emails undermine RFK Jr testimony about 2019 Samoa trip ahead of measles outbreak Kennedy later said the purpose of his trip had nothing to do with vaccines. US embassy and UN staff at the time said otherwise, emails show

RFK Jr said during his Senate confirmation hearings that his trip to Samoa in 2019 ahead of a devastating measles outbreak had “nothing to do with vaccines." Documents obtained by @us.theguardian.com and @apnews.com undermine that testimony. Details here, by me and @aliswenson.bsky.social ⬇️

Newly revealed emails undermine RFK Jr testimony about 2019 Samoa trip ahead of measles outbreak Kennedy later said the purpose of his trip had nothing to do with vaccines. US embassy and UN staff at the time said otherwise, emails show

Not really a surprise, but it's still surprising to me that some chose to believe his lie