les discussions sur les LLM que je vois passer ici ce matin me font repenser à cette vieille boutade de Roy Tennant, qui a longtemps travaillé à l'OCLC :
"Only librarians like to search, Everyone else likes to find."
Je crois que ça n'a jamais été aussi vrai
I had a great time at Uni Copenhagen giving a talk about How Generative AI impacts Bio-Image Data Science this week. You find my slides online and a recording will be shared soon!
doi.org/10.5281/zeno...
Big thanks to @danishbioimaging.bsky.social, @claraprats.bsky.social and team for hosting me!
N'hésitez pas à utiliser l'excellent moteur de recherche
sciences.re/postes/
As far as I can tell, uv doesn't have a command to automatically upgrade a pinned version of a package to the latest version.
What do you do to work around this issue?
#Python #uv
🦋🇪🇺 Eurosky (ou tout PDS alternatif), comment ? Pourquoi ?
Un petit fil pour s'y retrouver ⬇️
🧪 Awesome announcement from the @quantstack.bsky.social team! Introducing notebook.link, share your computational notebook and have them run directly in the browser with no setup, powered by Jupyterlite and the xeus stack.
#datascience #scientificcomputing
Question ESR : est-ce que si on est enseignant-chercheurs, les "chefs" (directeur-trice de labo ou department / UFR, président-es d'université, et autres élus) sont nos "supérieur hiérarchique" ?
26.02.2026 12:28 — 👍 11 🔁 5 💬 19 📌 2
Very nice article by Danielle Gerhard in The Scientist on
“The Dynamic Lives of Intrinsically Disordered Proteins”
with quotes from Gabi Heller, @alexholehouse.bsky.social and myself about our shared love of and fascination with these proteins
www.the-scientist.com/the-dynamic-...
Webinar at EMBL-EBI: Advanced programmatic access to UniProt using Python. 5 March 2026. 15:00-16:00 GMT
Speaker's name, role, and affiliation, with a headshot. Emily Bowler-Barnett, Senior Scientific Curator, EMBL-EBI. Aurelien Luciani, Project Leader, EMBL-EBI.
Join us next week for a webinar on programmatic access to UniProt using Python. The webinar will focus on worked examples, with time for a Q&A at the end.
Registration is free but essential: www.ebi.ac.uk/training/eve...
📌 Le réseau MERIT et la @sfbi.fr lancent une #enquête sur les conditions de travail des bioinformaticiens.nes
📎 lnkd.in/e-hsQ-Ta
⏳ temps estimé : 20 minutes
📅 date limite de réponse : 31/03/2026
On compte sur vous pour y participer !
Logo MERIT SFBI
📌 Enquête MERIT-SFBI sur les conditions de travail des bioinformaticien·ne·s dans les instituts de recherche, universités, établissements d’enseignement et recherche, secteur associatif ou privé
📎 framaforms.org/enquete-meri...
⏳ temps estimé : 20 minutes
📅 date limite de réponse : 31/03/2026
Un sujet dont on ne parle pas assez... la reproductibilité en recherche !
#VeilleESR
INTERVIEW Sarah Cohen-Boulakia Professeure à l’Université Paris-Saclay et bioinformaticienne, Sarah Cohen-Boulakia est co-fondatrice du Réseau Reproductibilité et milite pour plus de transparence dans la diffusion des productions scientifiques.
Est-il simple de reproduire des résultats publiés ? Absolument pas et ce n’est pas nouveau. En tant que scientifique, nous avons tous expérimenté au moins une fois cette impossibilité, la plupart du temps par manque d’information. Il est même parfois impossible de reproduire nos propres résultats quelques mois plus tard… Nous sommes donc dans une vraie crise : une part importante des publications ne sont pas reproductibles (...)
🟢 Publier moins... mais mieux ?
Peut-être avez-vous déjà essayé de répliquer des travaux... Cette semaine, Sarah Cohen-Boulakia vous parle de reproductibilité. Son secret : la transparence
themeta.news/sarah-cohen-...
#VeilleESR #Reproductibilité @i4replication.bsky.social
REPLAY - "Sauver les logiciels ?"
Il y a 10 ans, une équipe d'ingénieurs et de chercheurs lançait un projet : sauvegarder le code source des logiciels libres. Retour sur cette aventure humaine et technique avec Roberto Di Cosmo, fondateur de @softwareheritage.org.
Vos outils de genAI produisent des résultats à la cohérence douteuse ?
Je vous partage l'exclamation de @leomignot.bsky.social après avoir lu une phrase nawak
"Les poètes sont là, ils sont dans la machine"
C'est beau.
A viewer for Parquet, SQLite, and Avro files in JupyterLab.
Check out our new JupyterLab extension: Arbalister. 🏹
Built upon Apache Datafusion, @jupyter.org , and @arrow.apache.org , it lazily fetches rows so that you can view files larger than memory!
blog.jupyter.org/instantly-vi...
UNESCO Recommendation on Open Science (2023) www.unesco.org/en/open-scie...
03.02.2026 17:01 — 👍 1 🔁 2 💬 0 📌 0
Time for a look back at the code that built our world. At the Software Heritage Symposium in Paris, we're visiting the Source Code Exhibition. See it online: https://www.sourcecode-exhibition.softwareheritage.org
#SWH10 #OpenSource
Roberto Di Cosmo rappelle les grandes étapes d’une décennie d’engagements au service des codes et logiciels
28.01.2026 13:40 — 👍 3 🔁 2 💬 0 📌 0
Software Heritage a 10 ans ! Bon anniversaire 🎂 @softwareheritage.org
www.softwareheritage.org/2025/11/25/s...
We are thrilled to introduce notebook.link, a platform that lets you create, share, and run Jupyter notebooks instantly in your browser.
Powered by JupyterLite and WebAssembly, it supports Python, R, C++, and a full in-browser terminal experience.
📖 Read the full story: medium.com/@QuantStack/...
Pandas 3.0 was just released yesterday!! 🤘
And guess what? You can already play with it in Notebook.link.
I quickly built a Notebook.link link for you to play with it now:
notebook.link/@martinRenou...
Bonjour, afin de contribuer à la présence des institutions sur Bluesky (et leur permettre de faciliter leur exil de X) , j'ai créé ce starterpack des comptes institutionnels nationaux français présents.
08.01.2026 10:10 — 👍 755 🔁 399 💬 66 📌 19We are thrilled to welcome Elsa Touma to the Deltablot team! She is joining us as a Full Stack Developer🚀 (We meant to take a photo at our office day yesterday but were too busy playing in the snow 🙂 )
08.01.2026 11:18 — 👍 6 🔁 2 💬 1 📌 0
URLs break. Code disappears. The #SWHID is the cryptographically strong, decentralized tech that guarantees persistence. Compute it yourself. (Plus, it's now an ISO standard.) https://www.softwareheritage.org/2025/11/20/swhid-seminar-post #CodeRescue
05.01.2026 19:38 — 👍 5 🔁 8 💬 0 📌 0
Logo SFBI avec Meilleurs voeux
✨ La SFBI vous adresse ses meilleurs vœux pour 2026 !
🤝 Nous continuerons ensemble à structurer et dynamiser la #bioinformatique, avec de nombreuses surprises/initiatives pour renforcer notre communauté.
📍 Rendez-vous aux @jobim2026.bsky.social du 30/06 au 3/07 à Strasbourg
📎 www.sfbi.fr
📢 Webinaires Janvier 2026
Découvrez nos rendez-vous pour bien démarrer l’année :
📅 13/01 – 11h : BibCnrs / 14h : Plan de gestion de données
📅 16/01 – 10h30 : TDM Factory
📅 20/01 – 10h : Les principes FAIR
📅 22/01 – 11h : Click & Read
📅 27/01 – 10h30 : TDM Factory
👉 www.inist.fr/nos-actualit...
👀🤯 Comment j'ai fait pour manquer ça !
Super documentaire sur l'histoire du language #Python : le rôle central de Guido van Rossum, des débuts ABC, l'influence d'Anaconda, le passage 2-> 3, les enjeux de parités et l'explosion des usages IA et le walrus operator
▶️ www.youtube.com/watch?v=GfH4...
s'agissant du CSI de l'institut de chimie la question de l'IA a été abordée ds son rapport de prospective 2023 qui est le rapport statutaire, différent de celui commandé par le PDG en 2024 pour justifier ses keylabs... bonne lecture, Camarade!
www.rapports-du-comite-national.cnrs.fr/wp-content/u...
