Mariène Wan (@marienewan) — Bluesky Profile

3 weeks ago

A reference-free pipeline for detecting shared transposable elements from pan-genomes to retrace their dynamics in a species - Genome Biology Background The role of transposable elements (TEs) in host adaptation has gained interest in recent years. Individuals of the same species undergo independent TE insertions, providing genetic variabil...

🚨📢📄 Article in press in Genome Biology doi.org/10.1186/s130...
We introduce panREPET, a reference-free pipeline to detect shared transposable element (TE) insertions across pangenomes and retrace their evolutionary dynamics #TEsky 🧵👇

48 35 1 1

8 months ago

Venez découvrir #REPET, un outil de détection, de classification et d'annotation d'éléments transposables en live avec Etienne Bardet en amphi E @jobim2025.bsky.social

@urgi-inrae.bsky.social

#JOBIM2025 #URGI #INRAE

6 3 0 0

8 months ago

Venez me voir au poster 2, pour découvrir l'URGI, une plateforme bio-informatique @urgi-inrae.bsky.social
@jobim2025.bsky.social
#JOBIM2025 #URGI #INRAE

5 6 0 0

8 months ago

Vous êtes à #JOBIM2025 et vous avez manquez le poster de @marienewan.bsky.social sur la nouvelle version de #REPET ? Rassurez vous une demo est organisé aujourd'hui à midi en amphi E. Vous découvrirez toutes les évolutions mises en place pour vous faciliter l'annotation des #transposons

8 6 0 0