@loucerac.bsky.social
Postdoctoral researcher at the Platform for Computational Medicine.
¡¡VUELVE EL DOLOR!! ¡Este 6 de noviembre #CineConMásCosas, con más cine y más cosas! LA SAGA QUE HIZO TEMBLAR A @juangomezjurado.com Es muy digno de cariño si ya lo reservas en Amazon o donde quieras 😊. Y si retuiteas esto, pues me caso contigo.
08.10.2025 10:15 — 👍 59 🔁 36 💬 6 📌 8
Por si no te enteraste en las #JABI2025... 🔜 ¡Nos vemos el próximo año en Córdoba!
Gracias a todos los asistentes, tanto participantes como público, por hacer de la tercera edición un evento lleno de aprendizaje, comunicación, y relaciones profesionales. 🧬
Next stop... ¡JABI 2026 en Córdoba!
¡Es el turno ahora de Carlos Leucera! Viene a recalcar la importancia de la reproducibilidad, usando como ejemplo su estudio de aplicación de algoritmos de Machine Learning en datos obtenidos a partir de la Base Poblacional de Salud 🤖
14.05.2025 07:44 — 👍 1 🔁 1 💬 0 📌 0
Y antes del break... ¡Luis Seoane llega a las #JABI2025 para deleitarnos con su charla plenaria: "Hierarchical genotype networks and incipient ecological speciation in Qß phage quasispecies"!
14.05.2025 08:18 — 👍 3 🔁 1 💬 1 📌 0
La primera jornada de las #JABI2025 finaliza con Aureliano Bombarely y su charla plenaria: "How Bioinformatics can help us to understand better plant evolution and domestication" 🌱
¡Un cierre por todo lo alto para un día centrado en la bioinformática vegetal!
The Spanish Polygenic Score reference distribution: a resource for personalized medicine @xdopazo.bsky.social idp.nature.com/authorize?re...
25.04.2025 09:38 — 👍 2 🔁 2 💬 0 📌 0#iwwbio2025 #iwwbio IWBBIO 2025 is almost here, this year again in Gran Canaria (July 16 to 18, 2025) 🧬 🖥️ 🌴 . Don't miss it!
Submit your work to our SS6. EMPOWER-RWD: Empowering Healthcare through Evidence from Real-World Data
iwbbio.ugr.es/proposals.html
On the lack of openness of open-source #AI models
@nature.com
nature.com/articles/d41...
IWBBIO 2025 is almost here, this year again in Gran Canaria (July 16 to 18, 2025) 🧬 🖥️ 🌴 . Don't miss it!
Submit your work to our Special Session SS1: High-throughput genomics: tools for medical genomics and epidemiological surveillance.
iwbbio.ugr.es/proposals.html
Se ha filtrado el borrador de ley de universidades que prepara la cortijera Ayuso. Si se aprueba, será la muerte de la universidad pública.
Llamadme pesimista, pero quizás prospere dada la habitual desidia de los propios afectados y de unos madrileños anestesiados y borrachos de cañas (sigue)
54K WGS! Whole-genome sequencing analysis identifies rare, large-effect noncoding variants and regulatory regions associated with circulating protein levels www.nature.com/articles/s4...
16.03.2025 14:15 — 👍 9 🔁 3 💬 0 📌 0
New preprint! We worked with @msftresearch.bsky.social and @broadinstitute.org to see whether large language models (LLMs) can be useful to variant scientists in deciding whether genetic variants seen in a patient are responsible for their disease. tl;dr yes they can: www.biorxiv.org/content/10.1...
15.03.2025 02:43 — 👍 143 🔁 47 💬 1 📌 1bsky.app/profile/brod... new release of rix. Every #Rstats user interested in reproducibility should give rix a try. @brodriguesco.bsky.social created this great pkg and I put a lot of work into automatically fetching the remote dep of R GitHub pkg of a similar date. @tommytang.bsky.social
16.02.2025 18:40 — 👍 5 🔁 4 💬 1 📌 0
Improvements in LM (top) and EM (bottom) of our micro-sam model (finetuned) compared to the default SAM model.
After a long journey, Segment Anything for Microscopy is now published in Nature Methods! We significantly improve SAM for interactive and automatic segmentation in light and electron microscopy and build a user-friendly tool.
www.nature.com/articles/s41...
8/ Action Item
Check your files today. Rename them using these principles.
More on good file naming:Jenny Bryan’s guide speakerdeck.com/jennybc/how...
Key takeaways:
• Gene symbols have aliases, synonyms, and orthologs, adding complexity to gene data integration.
• Use HGNChelper to standardize gene symbols.
Esta tarde hablaré en #ENZOEM de SIEGA, la Plataforma de vigilancia genómica de patógenos que hemos desarrollado con más de 3000 genomas de 7 especies bacterianas #onehealth y clínicas + #westnilefever y otros www.clinbioinfosspa.es/projects/sie...
06.02.2025 10:56 — 👍 1 🔁 1 💬 0 📌 0
🧑💻 ¡Bioinformátic@s de Andalucía y España (y más allá)! ¿Os habéis inscrito ya a las #JABI2025 ?
✍️ Solo tenéis que registraros en https://jabi2025.uma.es/. ¡Así de simple!
🆕 Además, si os inscribís antes del 11 de abril podréis disfrutar de un precio reducido. No digáis que no os avisamos...
📢 ¡Las Jornadas Andaluzas de Bioinformática han llegado a Bluesky, y con un gran anuncio!
¿Teníais ganas de JABI? ¡Pues ya está aquí la III edición! #JABI2025
📆 Del 12 al 14 de mayo de 2025, en el IHSM «La Mayora» @ihsmumacsic.bsky.social, en Málaga
🌐 Más detalles en https://jabi2025.uma.es/
CANDI: self-supervised, confidence-aware denoising imputation of genomic data
Some interesting ideas in here about how to have machine learning models output their "confidence" in addition to their prediction.
www.biorxiv.org/content/10.1...
Check out the upcoming 9th Disease Maps Community Meeting organised by the Biomechanics Research Unit, KU Leuven and University of Liège and hosted at the KU Leuven, Leuven - Belgium disease-maps.io/DMCM2025/ @dasciinst.bsky.social @mlsb-borgwardt.bsky.social
29.01.2025 15:05 — 👍 2 🔁 2 💬 0 📌 0Today, we are publishing the first-ever International AI Safety Report, backed by 30 countries and the OECD, UN, and EU.
It summarises the state of the science on AI capabilities and risks, and how to mitigate those risks. 🧵
Full Report: assets.publishing.service.gov.uk/media/679a0c...
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👉 Researchers world-wide take the CAMDA Challenge (contest.camda.info) - compete with the best in an open-ended data analysis contest and bring home the Camda Trophy!
www.linkedin.com/feed/update/...
The Call for Contributions to #CAMDA2025 is now open!
CAMDA (www.camda.info) is a full conference track at ISMB/ECCB (lnkd.in/daFA5Pg3).
@theevidencebase.bsky.social @loucerac.bsky.social @mlsb-borgwardt.bsky.social
23.01.2025 07:59 — 👍 3 🔁 2 💬 0 📌 0Ya me he enterado. Comparto info: Si estás migrando desde Twitter, instala la extensión de @sky-follower-bridge.dev en tu ordenador y encuentra la mayoría de tus seguidores/seguidos de Twitter en Bluesky. De una forma sencilla puedes seleccionar a quién seguir. Hace lo mismo con los bloqueados.
22.01.2025 17:32 — 👍 33 🔁 15 💬 5 📌 3
Si ves esto, publica un ángel(a).
16.01.2025 07:11 — 👍 1 🔁 1 💬 0 📌 0
Great seminar about RNAseq analysis in non-model organisms by @mgclaros.bsky.social . Interesting R-tool to easily analyze and visualize RNAseq data. Really nice! #RSeqFlow
github.com/mgclaros/RSe...
The cover image portrays a human composed of proteins who is examining their health status (represented by the ECG monitoring interface) with the assistance of artificial intelligence (represented by the chip and binary codes).
Something you don't see every day!
Digitizing the human proteome in >53,000 individuals with 15-year follow-up and, with machine learning, unraveling nearly 500 disease-causing proteins
www.cell.com/cell/fulltex...
open-access
Classification of non-TCGA cancer samples to TCGA molecular subtypes using compact feature sets www.cell.com/cancer-cell...
09.01.2025 15:15 — 👍 2 🔁 1 💬 0 📌 0
