Junior research scientist on metabolomics and agroecology
CR26-BAP-1 - The Fruit Biology and Pathology joint research unit offers a multidisciplinary environment (understanding of the underlying mechanisms of plant development or their interactions with pathogens or with the environment through to the application of this knowledge in translational research). The unit has a range of experimental facilities dedicated to growing and phenotyping plants. MeTA is a highly multidisciplinary team using approaches combining experimentation and modelling to study plant metabolism. Moreover, the team hosts the Bordeaux Metabolome platform that provides the tools necessary to explore metabolomic diversity. You will also benefit from its affiliation to the INBS MetaboHUB (metabolomics) and PHENOME (phenomic and phenotyping) networks.The metabolome gathers information about metabolic functioning that is at the heart of all living processes. Consequently, metabolomic analyses of biodiversity combined with artificial intelligence show the highly predictive nature of the metabolome, particularly during adaptation to extreme habitats. Metabolomics has been used to predict yield and understand the basics, and study plant/pest interactions and multi-stress responses. Your role will be to study agroecosystems using approaches combining metabolomics and modelling to update the mechanisms governing the relationships between organisms (plants, insects, microbiota, etc.) and/or determine ecosystem services. The ultimate purpose will be to develop predictive models dedicated to the ecological transition of agriculture.The project extends the understanding of links between metabolism programming and trade-offs with plant performance to agroecology, from plant to ecosystem scale.Your short-term objective will be to formulate a strategy drawing on the bibliography and to establish a network of national and international collaborations to identify high-performance agroecosystems adapted to different contexts or, on the contrary, to imbalanced agroecosystems. This is an essential step to fine-tune the project objectives. It concerns more particularly the identification of ecosystem services that will be targeted by modelling. Your medium-term objectives will be to conduct experiments on agroecosystems comprising various compartments (plants, microorganisms, soil, air, etc.) to obtain climatic and physiological data, assess ecosystem services, and collect samples from each compartment. Reproducible and interoperable data from organism metabolomes and phenomes could be obtained thanks to numerous possibilities provided by the Bordeaux Metabolome Platform, particularly high-throughput combined with high-resolution mass spectrometry. Statistical analyses and predictive models could be developed to establish links between metabolism and ecosystem services.Your long-term objectives will be to understand the metabolic and physiological mechanisms involved in agroecological system dynamics. Functional genomics approaches could be used to validate the strong hypotheses generated by modelling thanks to collaborations with other researchers from the team and the unit. The purpose of the project will be to propose new strategies for agriculture, such as decision-making tools based on predictive metabolomics.
📣We are opening a permanent Research Scientist (CRCN) position in metabolomics and agroecology in Bordeaux. If you have a PhD and want to work at the interface of metabolism, biodiversity and agroecosystems, you can find all the details here: jobs.inrae.fr/en/open-comp...
#metabolomics #academicJobs
30.01.2026 14:47 — 👍 4 🔁 2 💬 0 📌 0
S.P. in front of a slide with a PCA representing metabolomics data under three growth conditions
@sylvainprigent.bsky.social presented metabolomics data generated at @bdxmetabolome.bsky.social, combined with field trial data and ML approaches, at the final event of the Untwist project. A real pleasure for us to be part of this project since 2020!
15.01.2026 10:10 — 👍 6 🔁 3 💬 0 📌 0
Ce fut un tel plaisir de participer à l'organisation de ces JOBIM !
Encore merci à toute l'équipe d'organisation !
11.07.2025 19:42 — 👍 5 🔁 0 💬 1 📌 0
Cathleen presenting phytochemical characterisation of a big diversity of plant species
This morning, Cathleen presented results at the GPR-BPS general assembly, based on data acquired on our metabolomics platform. Great to see our work contributing to broader research efforts! #Metabolomics
13.06.2025 09:35 — 👍 2 🔁 1 💬 0 📌 0
LinkedIn
This link will take you to a page that’s not on LinkedIn
🌱 Le comité d'organisation de #JOBIM2025 remercie chaleureusement le GPR BPS pour son soutien au congrès qui se tiendra les 8-11 juillet à Bordeaux.
Vous ne connaissez pas le GPR BPS ? 🤔
1/2 ⤵️
23.05.2025 08:19 — 👍 1 🔁 3 💬 1 📌 0
‼️ Rappel ‼️
📍 La SFBI propose 15 bourses de voyage pour @jobim2025.bsky.social !
ℹ️ Plus d'informations : www.sfbi.fr/blog/article...
📎 Dossier accessible en ligne : www.sfbi.fr/static/doc/S...
⏳ Soumission des dossiers du 15 mai au 5 juin 2025
✉️ Pour toutes questions : contact@sfbi.fr 🙂
27.05.2025 10:33 — 👍 4 🔁 4 💬 0 📌 1
the picture above is the group of researchers, PhD students and postdocs who organized the conference. They are in the room where the conference was held and in the background there is a slide with the conference title.
The bottom picture is a group picture of all the participants standing in front of the Institute for Grape and Wine Sciences.
Quelques 📸 des Journées Jeunes Chercheur·e·s du département BAP, à Bordeaux 14-16 mai
Organisées par un comité local, elles ont permis de mettre en valeur les travaux scientifiques des doctorant·e·s et postdoc via des présentations orales, posters, échanges scientifiques et moments de convivialité 👏
21.05.2025 10:55 — 👍 8 🔁 3 💬 0 📌 0
plants.peercommunityin.org, new Peer Community In .. PLANTS !
27.04.2025 09:05 — 👍 31 🔁 17 💬 0 📌 1
EXPLOR’AE : INRAE dévoile des projets de recherche en rupture et à haut risque
DOSSIER DE PRESSE - Le programme France 2030 « Accélération de la recherche à risque en Agriculture, Alimentation et Environnement » EXPLOR’AE offre un cadre inédit pour soutenir des projets de recher...
Coup de projecteur sur des projets en rupture et à haut risque du programme EXPLOR’AE
✔️39 idées exploration et 5 projets transformation déjà financés #France2030
Des hypothèses originales pour des innovations de rupture, des recherches qui sortent des sentiers battus !
url.inrae.fr/44ySyng
16.04.2025 09:08 — 👍 11 🔁 6 💬 0 📌 0
We're hiring!
We're looking for a postdoc in systems biology with a focus on metabolic modeling
Great science, great people and a great place to work (yes, I’m biased)
The position will be co-supervised by the brilliant @cfrioux.bsky.social
Details&application: recrutement.inria.fr/public/class...
08.04.2025 07:17 — 👍 3 🔁 4 💬 0 📌 0
Je veux en être !
01.04.2025 07:08 — 👍 2 🔁 0 💬 0 📌 0
Dans moins d'une semaine, l'appel à soumissions pour #JOBIM2025 sera fini ‼️
🕛 Pour rappel, vous avez jusqu'au lundi 31 mars, à 23h59 (CET), pour nous partager vos travaux.
Alors bon courage à tou.te.s pour cette dernière ligne droite !
26.03.2025 09:29 — 👍 1 🔁 2 💬 0 📌 0
Coralie devant sa slide de présentation divisée en deux, la partie gauche la représentant accompagnée de son chat en train d'étudier une carte du métabolisme
La partie droite représente Batman et Robin devant une carte des crimes de Gotham
En travaillant ensemble ils vont sauver le monde !
Aujourd'hui Coralie de #meta présentait son sujet de doctorat dans MT180
Trois minutes de présentation pour nous apprendre comment Batman et elle-même peuvent utiliser les réseaux métaboliques pour sauver le monde !
27.03.2025 15:19 — 👍 3 🔁 2 💬 0 📌 0
N'oubliez pas, la finale de #mt180 à Bordeaux c'est aujourd'hui !
Venez notamment entendre parler de réseaux métaboliques et de métabolomique !
27.03.2025 07:14 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0
✨ PLUS QUE DEUX MOIS avant #pint25 ✨
📍 +55 villes, du Parc naturel du Limousin à la Réunion et la Guyane
🔬 Des centaines de scientifiques passionné·e·s
🫂 500 organisateurs·trices à fond !
📱 Programme : 31 mars
🎟 Tickets : 14 avril
👉 pintofscience.fr
19.03.2025 08:10 — 👍 51 🔁 49 💬 0 📌 2
Juste un petit rappel au cas où ... mais la deadline des #soumissions pour #JOBIM2025 c'est dans quelques jours ... ⏲️ Ce serait dommage de la louper 😃 On a hâte de voir les travaux de la communauté 🤓
04.03.2025 17:02 — 👍 2 🔁 4 💬 0 📌 1
EXCLUSIVE: NSF starts vetting all grants to comply with Trump’s orders
Grantee accounts remain frozen, while union accuses NSF of ignoring rules governing peer review
Exclusive: NSF this week began to search through billions of dollars of grants the agency has already awarded for anything touching on topics that President Donald Trump has criticized. And NSF has blocked grantees and trainees from accessing funds while the review is underway. scim.ag/3El0NZh
30.01.2025 23:26 — 👍 753 🔁 579 💬 69 📌 200
➡️ M Björn GRÜNING sera #keynote speaker à #JOBIM2025
Il nous vient d'Allemagne, du département d'Informatique de l'Université de Freiburg.
💡 Si les workflows, la reproductiblité et la science ouverte vous intéressent, venez l'écouter et le rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
21.01.2025 09:03 — 👍 12 🔁 12 💬 0 📌 0
"Traitement et intégration des données en métabolomique, et statistiques" est le second domaine tiré au sort !
➡️ Mme Emma Schymanski sera #keynote speaker à #JOBIM2025
Emma nous vient du Centre pour la Biomédecine Systémique de l'Université du Luxembourg.
📊 Si les statistiques, le traitement ou l'intégration de données métabolomiques vous intéressent, rendez-vous en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
22.01.2025 08:55 — 👍 6 🔁 5 💬 0 📌 0
"Méthodes et algorithmes pour les séquences" est le troisième domaine tiré au sort !
➡️ M Eric Rivals sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !
Eric mène sa recherche au Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier.
🧬 Si le développement de méthodes et d'algorithmes pour les séquences vous intéresse, rendez-vous en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !
23.01.2025 08:48 — 👍 3 🔁 3 💬 0 📌 0
"Génomique fonctionnelle et intégrative" est le quatrième domaine tiré au sort !
➡️ M Jean Monlong sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !
Il travaille à l'Institut de Recherche en Santé Digestive de Toulouse.
💊 Si la génomique fonctionnelle et intégrative vous intéresse, ne manquez pas de l'écouter et de le rencontrer en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !
27.01.2025 08:14 — 👍 7 🔁 5 💬 0 📌 0
"Génomique évolutive et phylogénie" est le cinquième domaine tiré au sort !
➡️ Mme Anamaria NECSULEA sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !
Anamaria travaille au Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive de Lyon.
🐒 Si la génomique évolutive et la phylogénie vous intéressent, ne manquez pas de l'écouter et de la rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
28.01.2025 09:41 — 👍 8 🔁 4 💬 0 📌 1
An ecosystem for producing and sharing metadata within the web of FAIR Data
AbstractBackground. Descriptive metadata are vital for reporting, discovering, leveraging, and mobilizing research datasets. However, resolving metadata is
Meet Maggot: a web-based tool for managing and sharing research metadata! It simplifies dataset organization, FAIR compliance, and collaborative metadata creation, enabling efficient sharing and documentation. #FAIRdata #OpenScience
doi.org/10.1093/giga...
14.01.2025 09:22 — 👍 0 🔁 1 💬 0 📌 0
L'appel à proposition pour les mini #symposiums de #JOBIM2025 est lancé !!
Un mini-symposium:
➡️ réunit des scientifiques autour d'une thématique spécialisée en #bioinformatique 🗣️
➡️ dure 3 heures ⌚
⌛Attention, vous avez jusqu'au Vendredi 17 Janvier 2025 à 18h pour nous envoyer vos propositions!
29.11.2024 13:48 — 👍 4 🔁 2 💬 1 📌 3
A photomontage displaying presentations about Microfluidics, Machine-learning, data contextualisation in plant science and multiscale metabolomics
Bordeaux Metabolome was well-represented at the 13th Metabohub Scientific Days! Theoretical insights and practical sessions were engaging and insightful. It was wonderful to meet in person after so many virtual meetings!
18.10.2024 12:42 — 👍 5 🔁 4 💬 0 📌 0
Un message du comité d'organisation de JOBIM 2025 est sorti d'une enveloppe qui vous est destinée.
Le message est un SAVE THE DATE; il indique que JOBIM 2025 aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025.
Il rappelle que JOBIM est un évènement annuel fédérateur de la bioinformatique française, et qu'il réunit chercheurs, ingénieurs et étudiants pour présenter de nouveaux outils et approches, ainsi que leur applications sur des données biologiques. Le tout, dans une ambiance chaleureuse aux côtés des acteurs français de la bioinformatiques.
Alors, pensez-bien à marquer ces dates! Du 8 au 11 juillet 2025, à Bordeaux.
🍂 Septembre touche déjà à sa fin... 🍃
Contrairement à nos efforts pour préparer un super JOBIM 2025 ! 🎉
Alors vous aussi, préparez-vous pour l'évènement annuel de la bioinformatique française, et marquez dès maintenant dans vos agendas qu'il aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025 !
30.09.2024 14:53 — 👍 3 🔁 2 💬 0 📌 0
Un graphique reprenant les informations du texte principal mais sous forme schématique
📢 Le 15 novembre de 13h30 à 16h30 MetaboHUB vous présentera les grandes orientations scientifiques de l'infrastructure pour la période 2025-2027, avec des développements pour une métabolomique plus robuste, plus sensible et intégrant les nouvelles avancées de l’IA
Lien d'inscription gratuite à venir
16.09.2024 14:47 — 👍 0 🔁 1 💬 0 📌 0
Metabolic engineer & plant biotechnologist. Interested in omega-3s and early 90s EDM.
La radio du Grand Mix
➔ http://linktr.ee/laradionova
Journées ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques | 30 Juin - 3 Juillet | @Strasbourg
i'm a bot tweeting random images from the pomological watercolor collection in the usda's national agricultural library. unofficial. built by @xor.blue
Bioinfo Genotoul is a bioinformatics core facility, engaged in agronomical, environmental, microbiological and food / health projects.
Streameureuse, militante, vulgarisateurice en psychologie sociale.
De gauche, non-binaire, autiste, handie et salement politisé. Je fais de la vulga, politique, jeux et je critique tout et toustes parait-il.
Mail Pro : Masquelierbenoitmortak@gmail.com
Compte officiel du réseau TBM - Transports Bordeaux Métropole 🚍🚊🛥️🚲🅿️ https://infotbm.com
Nous ne répondons pas aux messages pour l'instant.
Retrouvez-nous sur nos autres RS 👉 https://www.infotbm.com/fr/les-services-numeriques-de-tbm
Journals Publishing Exciting Research in Plant Sciences.
https://www.cell.com/molecular-plant
https://www.cell.com/plant-communications
Associate professor (Biochem.) 🔬
Plant metabolism and redox signalling 🌱🍅🍇
Heading Bordeaux Metabolome facility 🧪
Musician 🌈
Head of the Comparative Functional Genomics lab @Pasteur.fr | @inserm.fr | @erc.europa.eu
Comparative omics - Reproductive evolution - Data witchcraft.
Professor for Systems Biomedicine, University of Galway | Development of Digital Metabolic Twins and tools for personalised medicine/nutrition | Microbiome | Whole-body metabolic models | Constraint-based modelling | https://thielelab.eu/
35/elle
Artiste bidouilleuse pro.
Amoureuse de la nature, je collectionne plein de trucs et je suis de gauche.
Site: https://juliannemoriotart.wordpress.com/
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Le vent se lève, il faut tenter de vivre.
in silico Plants is an open-access journal dealing with all aspects of computational plant science.
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🧬La science pour la santé
L’Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm) est un établissement public dédié à la recherche biologique, médicale et à la santé humaine.
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