@sylvainprigent.bsky.social
Bioinformatics, metabolomics and Plant science
Ce fut un tel plaisir de participer à l'organisation de ces JOBIM !
Encore merci à toute l'équipe d'organisation !
Cathleen presenting phytochemical characterisation of a big diversity of plant species
This morning, Cathleen presented results at the GPR-BPS general assembly, based on data acquired on our metabolomics platform. Great to see our work contributing to broader research efforts! #Metabolomics
13.06.2025 09:35 — 👍 2 🔁 1 💬 0 📌 0🌱 Le comité d'organisation de #JOBIM2025 remercie chaleureusement le GPR BPS pour son soutien au congrès qui se tiendra les 8-11 juillet à Bordeaux.
Vous ne connaissez pas le GPR BPS ? 🤔
1/2 ⤵️
‼️ Rappel ‼️
📍 La SFBI propose 15 bourses de voyage pour @jobim2025.bsky.social !
ℹ️ Plus d'informations : www.sfbi.fr/blog/article...
📎 Dossier accessible en ligne : www.sfbi.fr/static/doc/S...
⏳ Soumission des dossiers du 15 mai au 5 juin 2025
✉️ Pour toutes questions : contact@sfbi.fr 🙂
the picture above is the group of researchers, PhD students and postdocs who organized the conference. They are in the room where the conference was held and in the background there is a slide with the conference title. The bottom picture is a group picture of all the participants standing in front of the Institute for Grape and Wine Sciences.
Quelques 📸 des Journées Jeunes Chercheur·e·s du département BAP, à Bordeaux 14-16 mai
Organisées par un comité local, elles ont permis de mettre en valeur les travaux scientifiques des doctorant·e·s et postdoc via des présentations orales, posters, échanges scientifiques et moments de convivialité 👏
plants.peercommunityin.org, new Peer Community In .. PLANTS !
27.04.2025 09:05 — 👍 31 🔁 17 💬 0 📌 1
Coup de projecteur sur des projets en rupture et à haut risque du programme EXPLOR’AE
✔️39 idées exploration et 5 projets transformation déjà financés #France2030
Des hypothèses originales pour des innovations de rupture, des recherches qui sortent des sentiers battus !
url.inrae.fr/44ySyng
Interesting critique in Nature Metabolism on misusing gene-centric tools for #metabolomics data 🧪.
Turns out metabolites ≠ genes🧬—and forcing them into gene-style pathway analysis can really skew results! Worth a read if you're into #systems-biology or #bioinformatics.
🔗 doi.org/10.1038/s422...
We're hiring!
We're looking for a postdoc in systems biology with a focus on metabolic modeling
Great science, great people and a great place to work (yes, I’m biased)
The position will be co-supervised by the brilliant @cfrioux.bsky.social
Details&application: recrutement.inria.fr/public/class...
Je veux en être !
01.04.2025 07:08 — 👍 2 🔁 0 💬 0 📌 0Dans moins d'une semaine, l'appel à soumissions pour #JOBIM2025 sera fini ‼️
🕛 Pour rappel, vous avez jusqu'au lundi 31 mars, à 23h59 (CET), pour nous partager vos travaux.
Alors bon courage à tou.te.s pour cette dernière ligne droite !
Coralie devant sa slide de présentation divisée en deux, la partie gauche la représentant accompagnée de son chat en train d'étudier une carte du métabolisme La partie droite représente Batman et Robin devant une carte des crimes de Gotham En travaillant ensemble ils vont sauver le monde !
Aujourd'hui Coralie de #meta présentait son sujet de doctorat dans MT180
Trois minutes de présentation pour nous apprendre comment Batman et elle-même peuvent utiliser les réseaux métaboliques pour sauver le monde !
N'oubliez pas, la finale de #mt180 à Bordeaux c'est aujourd'hui !
Venez notamment entendre parler de réseaux métaboliques et de métabolomique !
✨ PLUS QUE DEUX MOIS avant #pint25 ✨
📍 +55 villes, du Parc naturel du Limousin à la Réunion et la Guyane
🔬 Des centaines de scientifiques passionné·e·s
🫂 500 organisateurs·trices à fond !
📱 Programme : 31 mars
🎟 Tickets : 14 avril
👉 pintofscience.fr
Juste un petit rappel au cas où ... mais la deadline des #soumissions pour #JOBIM2025 c'est dans quelques jours ... ⏲️ Ce serait dommage de la louper 😃 On a hâte de voir les travaux de la communauté 🤓
04.03.2025 17:02 — 👍 2 🔁 4 💬 0 📌 1
Exclusive: NSF this week began to search through billions of dollars of grants the agency has already awarded for anything touching on topics that President Donald Trump has criticized. And NSF has blocked grantees and trainees from accessing funds while the review is underway. scim.ag/3El0NZh
30.01.2025 23:26 — 👍 762 🔁 587 💬 69 📌 204➡️ M Björn GRÜNING sera #keynote speaker à #JOBIM2025
Il nous vient d'Allemagne, du département d'Informatique de l'Université de Freiburg.
💡 Si les workflows, la reproductiblité et la science ouverte vous intéressent, venez l'écouter et le rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
"Traitement et intégration des données en métabolomique, et statistiques" est le second domaine tiré au sort !
➡️ Mme Emma Schymanski sera #keynote speaker à #JOBIM2025
Emma nous vient du Centre pour la Biomédecine Systémique de l'Université du Luxembourg.
📊 Si les statistiques, le traitement ou l'intégration de données métabolomiques vous intéressent, rendez-vous en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
"Méthodes et algorithmes pour les séquences" est le troisième domaine tiré au sort !
➡️ M Eric Rivals sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !
Eric mène sa recherche au Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier.
🧬 Si le développement de méthodes et d'algorithmes pour les séquences vous intéresse, rendez-vous en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !
"Génomique fonctionnelle et intégrative" est le quatrième domaine tiré au sort !
➡️ M Jean Monlong sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !
Il travaille à l'Institut de Recherche en Santé Digestive de Toulouse.
💊 Si la génomique fonctionnelle et intégrative vous intéresse, ne manquez pas de l'écouter et de le rencontrer en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !
"Génomique évolutive et phylogénie" est le cinquième domaine tiré au sort !
➡️ Mme Anamaria NECSULEA sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !
Anamaria travaille au Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive de Lyon.
🐒 Si la génomique évolutive et la phylogénie vous intéressent, ne manquez pas de l'écouter et de la rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !
Meet Maggot: a web-based tool for managing and sharing research metadata! It simplifies dataset organization, FAIR compliance, and collaborative metadata creation, enabling efficient sharing and documentation. #FAIRdata #OpenScience
doi.org/10.1093/giga...
L'appel à proposition pour les mini #symposiums de #JOBIM2025 est lancé !!
Un mini-symposium:
➡️ réunit des scientifiques autour d'une thématique spécialisée en #bioinformatique 🗣️
➡️ dure 3 heures ⌚
⌛Attention, vous avez jusqu'au Vendredi 17 Janvier 2025 à 18h pour nous envoyer vos propositions!
A photomontage displaying presentations about Microfluidics, Machine-learning, data contextualisation in plant science and multiscale metabolomics
Bordeaux Metabolome was well-represented at the 13th Metabohub Scientific Days! Theoretical insights and practical sessions were engaging and insightful. It was wonderful to meet in person after so many virtual meetings!
18.10.2024 12:42 — 👍 5 🔁 4 💬 0 📌 0
Un message du comité d'organisation de JOBIM 2025 est sorti d'une enveloppe qui vous est destinée. Le message est un SAVE THE DATE; il indique que JOBIM 2025 aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025. Il rappelle que JOBIM est un évènement annuel fédérateur de la bioinformatique française, et qu'il réunit chercheurs, ingénieurs et étudiants pour présenter de nouveaux outils et approches, ainsi que leur applications sur des données biologiques. Le tout, dans une ambiance chaleureuse aux côtés des acteurs français de la bioinformatiques. Alors, pensez-bien à marquer ces dates! Du 8 au 11 juillet 2025, à Bordeaux.
🍂 Septembre touche déjà à sa fin... 🍃
Contrairement à nos efforts pour préparer un super JOBIM 2025 ! 🎉
Alors vous aussi, préparez-vous pour l'évènement annuel de la bioinformatique française, et marquez dès maintenant dans vos agendas qu'il aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025 !
Un graphique reprenant les informations du texte principal mais sous forme schématique
📢 Le 15 novembre de 13h30 à 16h30 MetaboHUB vous présentera les grandes orientations scientifiques de l'infrastructure pour la période 2025-2027, avec des développements pour une métabolomique plus robuste, plus sensible et intégrant les nouvelles avancées de l’IA
Lien d'inscription gratuite à venir
After three months of intense work, the first experiment of the ANR-MEMENTO project on periphytic communities is complete !
#ANR-MEMENTO, #metabolomics, #ecotoxicology, #aquaticmicrobialcommunities,@AgenceRecherche, @INRAE_NA_BDX, @LMGE, @JoanArtigas, @UCA, @bdxmetabolome.bsky.social
[#Job] 📢 Our lab located in Toulouse, is offering a permanent position for a research fellow in molecular phytopathology - Determinism of host specificity in phytopathogenic bacteria 🦠.
▶️ Apply until 2024 March 5th
🔗 youtu.be/Hfpd2aZafCw
▶️ jobs.inrae.fr/en/open-compet…
Je veux en être !
04.01.2024 16:40 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0
2D architecture of strawberry plant
📢 New article published by the 🍓 group of #FDFE team in Acta Horticulturae @ishs_hort
« 2D representation of the plant architecture in strawberry » doi.org/10.17660/Act...
