markus

RNA xkcd.com/3056

Bitte am Sonntag wählen gehen! Noch nie war eine Wahl so wichtig für Deutschlands Zukunft.
#Btw2025

Öffentlich Laden ist absolut kein Problem. Auch Schnelladen an der Autobahn, bzw. am Autohof. Ja, ist teurer als zu Hause, aber lässt sich bei geschickter Wahl der LadekarteN!!! auch recht preiswert realisieren... Einzig das heilige römische Reich deutscher Ladekarten nervt.

single-cell computational methods Join the conversation

in case this is useful to someone in this massive platform migration: a starting pack for single-cell omics computational methods
go.bsky.app/GmS1cH

There is just too many lists 🧐🫠😅

@strnr.bsky.social is the author of that list, I believe 🙂 gotta ask him 😉

Without writing a small python script, not that I am aware of.

Maybe this is of help: in the bam file, cellranger adds a barcode attribute so for each read you can get the cell ID.

Zugzielanzeiger RE10910 (RE9 nach Aachen).

Heute mal auf @lokfuehrer-tim.bsky.social seiner Lieblingslinie unterwegs. Soweit so gut, jetzt vor Deutz staut es sich....

Zugzielanzeiger ICE1560 in München-Pasing, laut dem der Zug bereits in Günzburg verenden sollte. Natürlich ist der Zug aber bis zum regulären Halt Ulm Hbf planmäßig durchgefahren!

Zugzielanzeiger in München-Pasing. Ratet mal, ob der Zug zu seinem Ziel- und Endbahnhof Ulm gekommen ist, oder nicht.

Auflösung im Alt-Text :)

Bahn.expert Webseite

Aber als Berufspendelnde nutzt ihr schon bahn.expert, oder?

Die darin angezeigten Echtzeitdaten sind zwar auch nur so gut wie eingepflegt, aber aus meiner Erfahrung schon aktueller als DB Navigator...

PS: niemals den Angaben am Bahnsteig glauben. Die funktionieren maximal abgelöst vom Rest...

Das ist doch noch gar nichts verglichen mit der schwäbischen Mentalität 😅

Announcing the Ascona Workshop 

“Spatial and Temporal Statistical Modeling in Molecular Biology” 

in Ascona CH, 8-13 Sep 2024.
Statistical, computational& ML methods& appln's for spatial biological data, from nucleus, spatial omics of tissues to ecosystems & planetary-scale biology

spatialbio.net

Landscape taken from train between Buchloe and Munich.

The nice part of commuting to university by local train (in Germany) is: you have enough time to think about your research, the next steps within a project, and how you can tackle existing challenges.

And all of that, because coverage is so unreliable that you are not even distracted by Emails!

Coining a new acronym for researchers: STUPID — Studying Topics Uninformed by Prior Investigations in the Discipline. Applies broadly.

Das beobachte ich auch. Häufig wird (von Studierenden) weniger Zeit in das Studium gesteckt weil man arbeiten gehen muss. Das ist natürlich insbesondere in teuren Unistädten (München *hust*) sehr ausgeprägt...

GitHub - COMBINE-lab/simpleaf: A rust framework to make using alevin-fry even simpler A rust framework to make using alevin-fry even simpler - GitHub - COMBINE-lab/simpleaf: A rust framework to make using alevin-fry even simpler

10X Genomics just made the source for CellRanger available (but not open source); github.com/10XGenomics/...! While I strongly advocate for using truly open tools for sc preprocessing e.g. github.com/COMBINE-lab/..., this is still a huge win for computational transparency in single cell analysis! 🖥️🧬

Not enough people know about bioicons.com
Open source vector graphics. Free alternatives to BioRender.

View of Allgäu near Memmingen with Alps in background

The advantage of travelling by train to university in southern Germany - Nice view of the Allgäu and the Alps 🤗

Since I got into bluesky this way, again thank you for your invite!

I will try giving back to this effort by donating my spare codes!