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Joey Allen

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Researcher in ecology Freshwater ecology, microbial ecology, chemical ecology & a bit of ecotox Headwater streams, diatoms, pesticides, nitrate & climate change.

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Botulisme : une hécatombe dans les marais | Courrier de l'Ouest [Courrier de l'Ouest] Dans les zones humides de Loire-Atlantique, l’épizootie de botulisme tue des milliers d’oiseaux.

www.ouest-france.fr/environnemen...

Encore un exemple qui montre que l'on sous-estime certainement la violence de l'impact que le changement climatique va avoir sur les écosystèmes.

28.07.2025 23:01 — 👍 7    🔁 6    💬 1    📌 0

Et aussi ça... la question de la gestion des niveaux d’eau se pose dans beaucoup de zones de marais. bsky.app/profile/didi...

29.07.2025 09:23 — 👍 2    🔁 0    💬 0    📌 0

Les marais plus chauds sont moins oxygénés, ce qui favorise le développement de Clostridium botulinum, et entraine la mort de milliers d'oiseaux.

Et encore, il n'y a pas que le changement climatique...

28.07.2025 23:01 — 👍 5    🔁 0    💬 1    📌 0
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Botulisme : une hécatombe dans les marais | Courrier de l'Ouest [Courrier de l'Ouest] Dans les zones humides de Loire-Atlantique, l’épizootie de botulisme tue des milliers d’oiseaux.

www.ouest-france.fr/environnemen...

Encore un exemple qui montre que l'on sous-estime certainement la violence de l'impact que le changement climatique va avoir sur les écosystèmes.

28.07.2025 23:01 — 👍 7    🔁 6    💬 1    📌 0
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Meta-analysis on the effects of chemical stressors on freshwater ecosystem functions - Environmental Sciences Europe Background Despite considerable progress in our capacity for predicting the response of different trophic levels to chemical stressors, generalizable relations between chemical stressors and ecosystem...

New publication - meta-analysis on chemical effects on freshwater ecosystem functions. Lead by Alex Feckler from @RPTU. We established dose-response relationships across multiple studies. Freely available doi.org/10.1186/s123...

06.07.2025 11:27 — 👍 6    🔁 1    💬 0    📌 0
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Biodiversité : au Royaume-Uni, menace sur les rivières de craie, « derniers habitats irremplaçables » du pays Les travaillistes veulent simplifier les contraintes environnementales sur les infrastructures et le bâtiment. Les défenseurs de l’environnement s’inquiètent des conséquences pour les rares sites natu...

En Angleterre, la nature est vue comme un problème; les objectifs de croissance justifient d’affaiblir les mesures de protection de l’environnement et de détruire des biotopes irremplaçables.
www.lemonde.fr/planete/arti...

29.06.2025 19:57 — 👍 2    🔁 2    💬 0    📌 0

Magali Brosed de Ripisylve fera cet après-midi une présentation "Approche fonctionnelle et processus écologiques : repenser l'évaluation de l'état écologique des petites rivières" dans le cadre du webinaire Bioindication et biosurveillance des milieux aquatiques continentaux de l'AFL

19.06.2025 07:55 — 👍 1    🔁 1    💬 0    📌 0
Un ruisseau en forêt

Un ruisseau en forêt

Bienvenu sur le compte de l’association Ripisylve.
Ripisylve est une association dédiée à l’étude et à la préservation des milieux aquatiques et des milieux terrestres limitrophes.

18.06.2025 12:19 — 👍 2    🔁 1    💬 1    📌 0
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Essentiels et méconnus, les champignons sont menacés d'extinction 411 espèces de champignons sont menacées d'extinction mais ce chiffre et largement sous-estimé. Et, malgré la perte de 90 % des champignons des prairies et pelouses en 70 ans, ils ne bénéficient d'auc...

Le chiffre du jour : 411 🍄

C'est le nombre d'espèces de champignons menacées d'extinction. Et celui-ci est très sous-estimé.

En 70ans, 90% des champignons des prairies & pelouses ont disparu. Pourtant, aujourd'hui encore, ils ne bénéficient d’aucune protection.

Plus d'infos dans @reporterre.net 🔽

11.04.2025 09:24 — 👍 34    🔁 17    💬 2    📌 1
Des centaines de barils jonchent le sol de la vallée.

Des centaines de barils jonchent le sol de la vallée.

Fin mars 1977, de grandes quantités de produits chimiques hautement toxiques sont déversées dans les égouts de Louisville et polluent la rivière Ohio, dans le comté de Bullitt (Kentucky, États-Unis).
#PrintempsSilencieux
en.wikipedia.org/wiki/Valley_...
bullittcountyhistory.org/bchistory/va...

29.03.2025 15:42 — 👍 1    🔁 4    💬 1    📌 0
Couverture du Journal of the Cooper Ornithological Society “The Condor”, N°86, volume 3, août 1984.
Illustration: Un condor, ailes noires et tête rouge, plane au-dessus des montagnes.
Exemplaire de la bibliothèque de l’université de l'Idaho tamponné du 17 septembre 1984.

Couverture du Journal of the Cooper Ornithological Society “The Condor”, N°86, volume 3, août 1984. Illustration: Un condor, ailes noires et tête rouge, plane au-dessus des montagnes. Exemplaire de la bibliothèque de l’université de l'Idaho tamponné du 17 septembre 1984.

Résumé de l’article “Intentional Poisoning of Birds with Parathion”, par Ward B. Stone, Stephen R. Overmann et Joseph C. Okoniewski.
Intentional poisoning of birds by farmers is not uncommon but is rarely documented and given proper attention. Two recent cases from New York are illustrative. In the first, at least 5,120 birds, mostly Red-winged Black-birds (Agelaius phoeniceus), Common Grackles (Quiscalus quiscula) and Brown-headed Cowbirds (Molothrus ater) were killed by parathion- (an organophosphate insecticide) treated corn, which had been distributed on a truck farm in mid-March. In the second, at least 3,196 birds, mostly Common Grackles, Red-winged Blackbirds and European Starlings (Sturnus vulgaris), died after ingesting parathion-treated rye seed spread near unharvested field corn in late March. A Cooper's Hawk (Accipiter cooperii), two Red-tailed Hawks (Buteo jamaicensis) and an American Kestrel (Falco sparverius) were killed in these cases after consuming poisoned icterids. Small numbers of birds in six other species were also killed in these incidents.

Résumé de l’article “Intentional Poisoning of Birds with Parathion”, par Ward B. Stone, Stephen R. Overmann et Joseph C. Okoniewski. Intentional poisoning of birds by farmers is not uncommon but is rarely documented and given proper attention. Two recent cases from New York are illustrative. In the first, at least 5,120 birds, mostly Red-winged Black-birds (Agelaius phoeniceus), Common Grackles (Quiscalus quiscula) and Brown-headed Cowbirds (Molothrus ater) were killed by parathion- (an organophosphate insecticide) treated corn, which had been distributed on a truck farm in mid-March. In the second, at least 3,196 birds, mostly Common Grackles, Red-winged Blackbirds and European Starlings (Sturnus vulgaris), died after ingesting parathion-treated rye seed spread near unharvested field corn in late March. A Cooper's Hawk (Accipiter cooperii), two Red-tailed Hawks (Buteo jamaicensis) and an American Kestrel (Falco sparverius) were killed in these cases after consuming poisoned icterids. Small numbers of birds in six other species were also killed in these incidents.

Table 1. Espèces et nombres d’oiseaux tués pas le parathion dans les fermes de Newburgh et Albany, état de New York.

Table 1. Espèces et nombres d’oiseaux tués pas le parathion dans les fermes de Newburgh et Albany, état de New York.

Le 30 mars 1982, l’emploi par un fermier de grains de seigle traités au parathion, un insecticide organophosphoré, cause entraîne la mort de trois mille cent quatre-vingt-seize oiseaux à Albany (New York, États-Unis).
#PrintempsSilencieux
doi.org/10.2307/1367...

30.03.2025 14:03 — 👍 1    🔁 1    💬 1    📌 0
Peut-on appliquer les principes de l'écologie du paysage à l'échelle microscopique ? | Observatoire des sciences de l'environnement de Rennes

Peut-on appliquer les principes de l'écologie du paysage à l'échelle microscopique ?

oseren.univ-rennes.fr/actualites/p...

11.02.2025 22:57 — 👍 1    🔁 0    💬 0    📌 0

Aujourd'hui, j'ai assisté à une journée dédiée à l'installation de jeunes agriculteurs (enfin, surtout aux reprises d'exploitations) sur le territoire du Parc régional des marais Cotentin-Bessin. Au menu, présentation des acteurs, témoignages d'agriculteurs (cédants/s'installant), ateliers. 1/

06.02.2025 19:34 — 👍 32    🔁 6    💬 3    📌 2
Le ruisseau du Petit Hermitage dans la forêt de Villecartier, en Bretagne.

Le ruisseau du Petit Hermitage dans la forêt de Villecartier, en Bretagne.

La larve du trichoptère Anabolia nervosa dans son fourreau fait de brindilles et de grains de sable.

La larve du trichoptère Anabolia nervosa dans son fourreau fait de brindilles et de grains de sable.

Une image de diatomée, sur laquelle on peut deviner quelques bactéries observée au microscope électronique à balayage

Une image de diatomée, sur laquelle on peut deviner quelques bactéries observée au microscope électronique à balayage

Les ruisseaux, la biodiversité, les champignons, diatomées et autres microorganismes aquatiques ou bien les insectes aquatiques vous intéressent. Notre dernier article parle de tout cela. Vous pouvez le trouver ici authors.elsevier.com/a/1k1b6B8cd0...
Ou là hal.science/hal-04763773v1

02.12.2024 23:29 — 👍 11    🔁 5    💬 2    📌 0
Un ruisseau forestier de montagne

Un ruisseau forestier de montagne

Des diatomées "photographiées" au microscope électronique

Des diatomées "photographiées" au microscope électronique

Les diatomées sont des algues microscopiques. Elles sont très étudiées dans les rivières et le milieu marin, mais savez-vous qu'elles sont présentes dans les ruisseaux et que, bien qu'elles ne soient pas très abondantes, elles jouent un rôle majeur dans ces petits cours d'eau ?

12.11.2024 15:39 — 👍 9    🔁 4    💬 1    📌 3

penser que la diversité microbiennes et les fonctions associées (production primaire, décomposition, captage de nutriments, et surtout la résilience de ces fonctions aux perturbations) pourraient être significativement affectées.

05.12.2024 00:20 — 👍 2    🔁 0    💬 0    📌 0

fourreaux et du reste du ruisseau ne sont pas cloisonnées, et on peut voir le fourreau comme une sorte de refuge de diversité microbienne qui va constamment enrichir les communautés sur les autres substrats. Dans ce cas, si on avait un fort changement des communautés de trichoptères on peut...
3/x

05.12.2024 00:20 — 👍 2    🔁 0    💬 1    📌 0

Mais dans l'absolu, ça me semble une hypothèse assez raisonnable. Je ne pense pas que les fourreaux eux mêmes représentent une surface suffisamment importante pour que les processus à leur surface aient un impact significatif à l'échelle du ruisseau.
Par contre, les communautés à la surface des
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05.12.2024 00:20 — 👍 2    🔁 0    💬 1    📌 0

Merci.
Alors pour ce que j'envisage par la suite...

C'est une étude que j'ai porté alors que j'étais sur des contrats très précaires. Étant arrivé au bout de mes possibilités de renouvellement de contrats, je suis loin d'être sûr d'être un jour en mesure de poursuivre sur cette thématique.
1/x

05.12.2024 00:20 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

J'espère que cela répond à tes questions

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0
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Net-spinning caddisflies create denitrifier-enriched niches in the stream microbiome AbstractLarval net-spinning caddisflies (Hydropsychidae) function as ecosystem engineers in streams where they construct protective retreats composed of or

Il faudrait faire encore pas mal d'études pour comprendre exactement les mécanismes derrière. D'autres études ont aussi montré comment d'autres types de trichoptères (sans fourreau cette fois-ci) créent une diversité de microenvironnements. doi.org/10.1038/s437...

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Cet effet est certainement réduit pour les diatomées qui vont être à la surface du fourreau par rapport aux champi et bactéries que l'on retrouve aussi à l'intérieur de fourreau et qui sont donc plus affecté par les substances produites par la larve.

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Mais comme vous le suggériez, d'autres facteurs peuvent jouer, notamment du fait que la larve va enrichir le milieu localement avec diverses substances.

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Le trichoptère peut bien sur être emporté par le courant de temps en temps, mais l'activité de la larve va lui permettre de revenir dans des conditions proches.
Je pense que cette stabilité permet d'avoir vraiment une diversité de micro-environnements qui explique en grande partie nos résultats.

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

... des conditions bien moins favorables. Même chose pour les débris organiques qui sont très peu stables dans le ruisseau.
Sur un fourreau ou trouvera des espaces exposés de façon plus stable à la lumière, des espaces protégés du courant formés par les "crevasses" entre deux grains de sable.

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Il peut y avoir plusieurs éléments d’explication.
Un point important est que l'on est dans un ruisseau avec un fond très sableux, et le sable bouge très facilement avec le courant. Une diatomée qui se fixerait sur un grain de sable bien exposé à la lumière peut très rapidement se retrouver dans ...

03.12.2024 14:16 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 1

Et pour finir, merci à toutes celles et ceux qui ont contribué à ce projet par leurs idées, leur connaissance des ruisseaux bretons et de leurs habitants, leur aide sur le terrain, au labo, dans l’analyse des données ou la rédaction de l’article. Je n’aurais rien pu faire seul.

02.12.2024 23:29 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Voilà, c'est tout pour le résumé de l'article. Si vous souhaitez en savoir plus n'hésitez pas à aller le lire ou à me poser des questions.

Toutes les données sur lesquelles cet article s’appuie etque le code R utilisé sont disponibles sur la base de données publique InDoRES doi.org/10.48579/PRO...

02.12.2024 23:29 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Cette perte de diversité pourrait à terme affecter les fonctions essentielles du ruisseau et le rendre moins résilient face à des perturbations.

02.12.2024 23:29 — 👍 2    🔁 0    💬 1    📌 0

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