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Accelerate Your Science with Technology. 「技術で科学を加速する」 バイオ系データサイエンティスト・リサーチアシスタントエンジニア neurodata.tokyo
これでポスターや論文のFigure作りのツールに悩まなくて済む！😍
クリエイター向けツール『Affinity』が完全無料化。『Designer』『Photo』『Publisher』3つのソフトが統合され1本へ。今後のアプデもずっと無料 | ゲーム・エンタメ最新情報のファミ通.com www.famitsu.com/article/2025...
“Google for DNA” brings order to biology’s big data: ETH Zurich’s MetaGraph compresses and indexes DNA/RNA/proteins, enabling Google-like search.
www.nature.com/articles/d41...
プログラミング技術で科学の発展を促進しようという試み、大注目です🤩
「Julia x OSS で科学の未来をもっと早く！プログラム開発の効率化で科学の発展を加速する」
academist-cf.com/projects/394...
ALT Ear-training, chord finder, and more — right in your browser.
As a hobby side project, I've built browser-based music practice tools🎹🎧
It includes an ear trainer, guitar chord finder, YouTube video looper & speed changer — all things I personally wanted to use. It’s totally free and open to everyone—give it a try!
👉 music-tools.neurodata.tokyo
グラフの見た目からの可視化手法逆引き辞典（順次公開）
作成ツールのご紹介その5：グラフの読み方＋コード事例集
論文でよく見るあの図、何て名前？どうやって解釈するの？どうやって作るの？使いどころは？そんな疑問に答えるための、グラフの見た目からの可視化手法逆引き辞典です（PythonとRのサンプルコード付）。順次更新予定。
ronsapo.neurodata.tokyo/graph-examples
候補日と時間帯を設定し、参加者に共有できるイベントを作成します。
作成ツールのご紹介その4：日程調整
説明不要ですね。会議なり飲み会なり趣味の会合なり、お好きなイベントの日程調整にご活用ください。
ツールの利用はこちらから： ronsapo.neurodata.tokyo/schedule/cre...
ツールの利用はこちらから： ronsapo.neurodata.tokyo/pdf-tools
31.07.2025 13:24 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0
PDFファイルのマージと分割
作成ツールのご紹介その3：PDFマージ・分割
PDFから不要なページを除いたり、二つのファイルを結合したい時ってありますよね。今、目の前の1ファイルを処理したいだけなのに高い有料ソフトを払うのは勿体ない……そんなときにご活用頂けるかと思います！
ツールの利用はこちらから： ronsapo.neurodata.tokyo/text-cleaner
31.07.2025 13:13 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0
PDFからコピーしたテキストの不自然な改行やハイフンを削除し、読みやすく整形します。
作成ツールのご紹介その2：PDFテキスト整形
PDFからコピペした文章には不自然な改行や余計なハイフンが入りがちです。本ツールはそういった無駄な要素を削除し、綺麗に整った文章へと整形します。読書メモや機械翻訳を行う際のちょっとしたストレスをなくしてくれる地味だけど助かるツールです！
【RStudioユーザー必見】Positronの導入・使い方を徹底解説｜わたヤク
note.com/ai_biostat/n...
ツールの利用はこちらから↓
ronsapo.neurodata.tokyo/character-co...
文字数カウントツールのスクリーンショット
作成ツールのご紹介その1：文字数カウント
類似ツールは世の中にいくらでもありますが、「データ、保存されてない？」「未発表の内容を入力して大丈夫？」と不安になることもありますよね。
私たちのツールは、入力情報を一切保存・再利用しないことを最重要の設計方針としています。
まだ開発を始めたばかりのサービスですので、色々至らぬ点があるかとは思います。バグレポートや機能追加のリクエストなど、こちらからご意見をお寄せいただけますと大変助かります！
docs.google.com/forms/d/e/1F...
研究活動支援ツール「Ronsapo」を作成しました！PDF編集や文字カウントのような「何かと便利なちょっとしたツール」から、英文校正や論文要約のような「AI技術を用いた最新支援ツール」まで揃えています。運用費がかかるのでAI機能だけは有料とさせていただいていますが、それ無しでもみなさんの研究活動のお手伝いが十分にできるのではと思います。どうぞご活用くださいませ！
ronsapo.neurodata.tokyo
- Google has announced the "AI co-scientist," a multi-agent AI system based on Gemini 2.0
- It integrates vast scientific literature to generate new hypotheses, outline research overviews, and propose experimental methods
research.google/blog/acceler...
- GoogleがGemini 2.0を基盤としたマルチエージェントAIシステム「AI co-scientist」を発表
- 膨大な科学文献を解析し、新たな仮説の生成、研究概要作成、実験手法の提案までをサポート
research.google/blog/acceler...
LLMが分子生物学やバイオインフォマティクスでどう活用されうるかを議論した記事
ai-scholar.tech/articles/lar...
Thank you for the wonderful connections and support in 2024. Since starting our challenge in April, we’ve had the opportunity to work on many projects and grow each day. In 2025, we look forward to new challenges and continued growth. Happy New Year!
27.12.2024 06:28 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 02024年も多くのご縁をいただき、みなさまに心より感謝申し上げます。4月からスタートしたこの取り組みも、おかげさまで多くの支援を手掛けることができ、充実した日々を過ごすことができました。皆様に支えられ、日々成長を実感できたことに感謝の気持ちでいっぱいです。
来年はこれまでの経験を活かしながら、さらに新しい挑戦にも取り組んでまいりたいと考えております。2025年もどうぞよろしくお願いします！
Here's my approach: start with the GPTs below for a summary, do some Q&A with the GPTs, then dive into a close read. It greatly speeds up understanding, but the flood of new papers keeps growing—human capacity is near its limit. 🫠
chatgpt.com/g/g-8rviAV5V...
OpenScholar: AI for scientific paper research
- Finds papers & summarizes content for user queries
- Trained on 45M+ Semantic Scholar papers
- 8B parameters
GitHub: github.com/AkariAsai/Op...
科学論文の調査に特化したAIモデル「OpenScholar」
- ユーザーのクエリに応じて論文を見つけ、その内容に基づいた回答を生成
- Semantic Scholarに含まれる4500万件以上の論文と、対応する文章の組み合わせからなるデータセットを用いて訓練
- パラメータ数はわずか80億
gigazine.net/news/2024112...
Interesting. LLMs exhibit modular structures, such as math/code lobes, resembling functional areas in the neocortex.
Just as cortical arealization occurs during development, could insights from developmental neuroscience refine AI architectures? 🧠🤖
arxiv.org/abs/2410.19750
We have released the MRI image (.nii) ⇔ PNG/TIFF conversion package on PyPI! 🎉 You can easily install it with pip install nifti-converter. (Although not mentioned in the README, it can also be easily used as a Python library.)
pypi.org/project/nift...
私たちが作成したMRI画像 (.nii) ⇔ PNG/TIFF 変換パッケージがPyPIに登録されました🎉 pip install nifti-converter で簡単にインストール可能です！
（READMEには記載できていませんが、Pythonライブラリとしても簡単に呼び出せるかと思います）
pypi.org/project/nift...
🚀 We just released a Python package that converts NIfTI neuroimaging data (.nii) to sequential image formats (.tiff/.png) and vice versa.🧠
Simplify your neuroimaging analysis and visualization workflows! github.com/neurodata-to...
MRI画像のハンドリングを簡便化するPythonパッケージを公開しました！NIfTI形式の画像 (.nii) をTIFFやPNGの連続画像に簡単に変換（またその逆変換）するためのツールです🧠
詳しくはGitHubをご覧ください github.com/neurodata-to...
