Gunilla Källenius @gunkal - Bluesky Profile

Welcome!

05.10.2025 20:52 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0

I agree. It helped me sort my thoughts.

01.10.2025 08:43 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0

Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation - Single Cell Portal Granulomas are classic manifestations of tuberculosis pathogenesis. They result from an ensemble of immune responses to Mycobacterium tuberculosis infection, but the identities, arrangement, cellular interactions, and regulation of the cells that comprise them have thus far been incompletely understood. To better understand the composition of granulomas, we conducted spatial and single-cell RNA sequencing of granulomas in biopsy specimens from patients with tuberculosis. We found that granulomas consist of concentric transcriptional laminae surrounding areas of central necrosis. We identified distinct populations of granuloma-associated stromal cells, fibroblasts, lymphocytes, mast cells, dendritic cells, neutrophils, and macrophages. Furthermore, gene expression among these cell populations differed by location within granulomas. We used inferential analysis to predict dominant granuloma cell-cell interactions, the activity of major signaling pathways, and transcription factor activities. Using spatial deconvolution, we mapped a conserved pattern of cellular organization dominated by macrophages rich in SPP1/osteopontin expression. Trajectory analysis of macrophage subtypes mapped their differentiation and supported the importance of SPP1 to granuloma macrophage polarization. Using the Mycobacterium marinum-zebrafish model, we found that mycobacterial infection induces spp1 expression in macrophages and that spp1 ablation results in granuloma formation defects and reduced survival in adult animals. Cumulatively, we have identified a dominant macrophage granuloma population as well as its central regulatory gene in human samples and confirmed the importance of spp1 to granuloma biology in vivo.

You can now explore the mRNA expression of your favorite TB gene of interest in our recently published human pulmonary M.tb granuloma single-cell dataset at the Broad Single Cell PORTAL!

@broadinstitute.org
@wallacewly.bsky.social

singlecell.broadinstitute.org/single_cell/...

04.09.2025 13:38 — 👍 18 🔁 6 💬 1 📌 1

Jösses

28.09.2025 07:36 — 👍 5 🔁 1 💬 3 📌 0

TB is the No. 1 killer among infectious diseases. A new study says its toll could mount New research estimates that as many as 2.2 million more people could die of tuberculosis if U.S. cuts to foreign aid become permanent.

New research estimates that as many as 2.2 million more people could die of tuberculosis if U.S. cuts to foreign aid become permanent.

13.09.2025 11:19 — 👍 697 🔁 359 💬 30 📌 31

”Förbannelsen” är en essä av högsta klass RECENSION En av de klokaste samtidsdiagnoserna på 2000-talet

Karin Petterssons ”Förbannelsen” är en essä av högsta klass, skriver gästrecensent Stefan Jonsson: www.aftonbladet.se/kultur/bokre...

03.09.2025 05:20 — 👍 16 🔁 7 💬 0 📌 3

Grattis till en viktig bok, och välförtjänt recension!

02.09.2025 13:46 — 👍 1 🔁 0 💬 1 📌 0

Rimlig/ legal rätt att (för)neka?

20.08.2025 13:40 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0

”Stöd till forskning är effektiv hjälp” DEBATT. Biståndsminister Benjamin Dousa bör återskapa och utöka stödet till forskning, särskilt i samarbete med länder i Afrika söder om Sahara. Det skapar långsiktig utveckling, skriver debattörer i ...

Skrev en replik till Benjamin Dousa om stöd till Afrika
www.svd.se/a/GydBx4/sto...

12.08.2025 22:35 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0

Fast väldigt länge sen. Kanske dags att börja om. När jag läste hans första bok (The Search) var jag inte medveten om hur personlig den var, att han lämnade forskningen på grund av en artikel i Nature som visade sig vara inkorrekt.

12.08.2025 07:04 — 👍 1 🔁 0 💬 1 📌 0

Ja varför har jag inte läst honom på länge?

11.08.2025 23:32 — 👍 1 🔁 0 💬 1 📌 0

Please let me introduce Dr. Farida Ouedraogo, an African STARS Fellow of the advancing translational training (ATT) programme. You will inspire many others in Africa to become both clinician scientists and innovators! #YoungAfricaWorks #AfricanSTARSfellows

07.08.2025 06:24 — 👍 9 🔁 2 💬 0 📌 0

Jag med, fast i Word

02.08.2025 14:30 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0

En grej med långvarig undernäring och svält är att det förstör kroppen på små barn och skapar livslånga men även för dem som överlever.

24.07.2025 08:53 — 👍 44 🔁 16 💬 1 📌 1

Congratulations @yichnliu.bsky.social! This is a great moment to launch your #glycotime tools company, we need access to more lectins for glycoprofiling and functional glycomics, and also future therapeutic applications 👏

14.07.2025 15:19 — 👍 14 🔁 3 💬 0 📌 0

Så intressant. Tycker att det snarare borde uppfattas som mindre akademiskt. Och användbart.

14.07.2025 09:06 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0

Anyone else who is denied access to PubMed?

09.07.2025 10:41 — 👍 0 🔁 0 💬 0 📌 0

Stimulating immune cells in vitro is a common experimental lab model. We profiled 150K blood immune cells treated with 11 different stimuli to compare the effects. The data are freely available for researchers. See the preprint for our findings and to access the data 🧪 doi.org/10.1101/2025...

03.07.2025 15:39 — 👍 128 🔁 42 💬 10 📌 1

TB or not TB: That depends on the antibody Fc Fc-swapped variant monoclonal antibodies reveal new mechanisms underlying Mycobacterium tuberculosis restriction.

As paper titles involving TB go, this one using the rhyming Fc is not bad...

(also a good synopsis of an important paper)
#IDSky #TBSky #immunosky

www.science.org/doi/10.1126/...

05.07.2025 23:28 — 👍 39 🔁 13 💬 2 📌 1

mycket välskrivet

05.07.2025 17:20 — 👍 4 🔁 0 💬 0 📌 0

Stort grattis!

03.07.2025 19:25 — 👍 2 🔁 0 💬 0 📌 0

This is so awful

01.07.2025 16:12 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0

Congratulations @kkranzer.bsky.social ! So well deserved!

23.06.2025 22:57 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 1

Kulturdebatt. Bäste Benjamin Dousa, vem har slängt dig under bussen? Sverker Sörlin frågar i ett öppet brev varför Sveriges biståndsminister har stoppat hjälpen till det svältande och sönderbombade Gaza.

Den här texten av Sverker Sörlin sätter ord på känslan av svek och förvirring som jag också känner. Frustrationen över att inte få ett rakt svar, av att det som sker är både grymt och obegripligt. www.dn.se/kultur/baste...

23.06.2025 08:53 — 👍 56 🔁 7 💬 2 📌 0

Read this.

17.06.2025 10:09 — 👍 4 🔁 2 💬 0 📌 0

För första gången inte

16.06.2025 08:16 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0

Så intressanta referenser. Lärde mig mycket.

08.06.2025 05:16 — 👍 3 🔁 0 💬 1 📌 0

Skulle verkligen vara intressant att veta mer om vaccinationsmotståndet på den tiden.

28.05.2025 06:14 — 👍 1 🔁 0 💬 0 📌 0

SA universities face funding crisis as US federal agencies freeze research grants | News24 An investigation into the impact of the US aid freeze on research funding to South African universities has found that 44 programmes worth R2.5 billion were affected.

A not very happy Friday. CERI had 6 NIH grants canceled, which will impact operations, surveillance and response to epidemics. We are working to try to minimize disturbance but not easy with 6 grants terminated at the same moment. A crisis is unfolding in SA www.news24.com/southafrica/...

23.05.2025 05:29 — 👍 88 🔁 50 💬 3 📌 5

Aha, då förstår jag. Har också letat.

15.05.2025 07:17 — 👍 2 🔁 0 💬 0 📌 0

Gunilla Källenius

Latest posts by gunkal.bsky.social on Bluesky

@gunkal is following 20 prominent accounts