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Thibault Tubiana

@ttubiana.bsky.social

Molecular Modeler | Postdoc at @I2BCParisSaclay | before @reuterlab @UiB | @Servier | PhD at @I2BCParisSaclay | Mastodon @ttubiana@mstdn.science

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Latest posts by ttubiana.bsky.social on Bluesky

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#SOSADOPTION, Aristo, 13 ans

💔 10 ans de refuge… et toujours personne.

Aristo a 13 ans. Il en a passé 12 au refuge, à regarder les autres partir, à espérer, à attendre. Et pourtant… Aristo est un amour de chien.

10.05.2025 08:04 — 👍 6    🔁 7    💬 1    📌 1
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Google Colab

Run BioEmu in Colab - just click "Runtime → Run all"! Our notebook uses ColabFold to generate MSAs, BioEmu to predict trajectories, and Foldseek to cluster conformations.
Thanks @jjimenezluna.bsky.social for the help!
🌐 colab.research.google.com/github/sokry...
📄 www.biorxiv.org/content/10.1...

29.03.2025 09:50 — 👍 102    🔁 42    💬 1    📌 2
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Retrouvez l'équipe "Du Neuf Docteur ?" au festival Pop'Sciences qui se tiendra les 16, 17, et 18 mai 2025 à Belle-en-Beaujolais. Nous vous ferons découvrir le monde fascinant des virus ! On vous attends nombreux·ses.
#duneufdocteur #vulgarisationscientifique #mediationscientifique

18.03.2025 11:19 — 👍 1    🔁 1    💬 0    📌 0
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Interactive visualization of large molecular systems with VTX: example with a minimal whole-cell model VTX is an open-source molecular visualization software designed to overcome the scaling limitations of existing real-time molecular visualization software when handling massive molecular datasets. VTX...

New pre-print from the team! Interactive visualization of large molecular systems with VTX: example with a minimal whole-cell model from @cg-martini.bsky.social

arxiv.org/abs/2503.07181
VTX is available on GitHub github.com/VTX-Molecula... and at vtx.drugdesign.fr

11.03.2025 09:08 — 👍 17    🔁 4    💬 0    📌 0

Super merci ! C’est dingue que nous devons nous même se relayer les infos…

27.01.2025 15:39 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

On a reçus un mail il y a 2 semaines pour la non réouverture de geslab, c’est un nouveau mail?

27.01.2025 15:29 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Est-ce qu’il a été question de réduire le crédit impôt recherche plutôt ? Comme ça l’argent pour la recherche va… à la recherche ?

20.01.2025 21:40 — 👍 1    🔁 0    💬 0    📌 0

Hey @verenaresch.bsky.social it’s nice to see you here ☺️

22.11.2024 07:51 — 👍 1    🔁 0    💬 1    📌 0

Omg I love it 🤩

20.11.2024 08:30 — 👍 1    🔁 0    💬 0    📌 0

Thanks ☺️

18.11.2024 12:20 — 👍 0    🔁 0    💬 0    📌 0
3D illustration of our work on norovirus NS4 self-assembles into various membrane-bridging multimers https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.107724

3D illustration of our work on norovirus NS4 self-assembles into various membrane-bridging multimers https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.107724

Different virus capsid size

Different virus capsid size

3D Illustration of lanreotide nanotubes observed in cryoEM
https://doi.org/10.1073/pnas.2120346119

3D Illustration of lanreotide nanotubes observed in cryoEM https://doi.org/10.1073/pnas.2120346119

Molecular dynamic simualtion Snapshot of a membrane donut with a carbone nanotube inserted.

Molecular dynamic simualtion Snapshot of a membrane donut with a carbone nanotube inserted.

First post #HelloESR 😉
Chercheur #CNRS qui a fraichement eu son poste à l' #I2BC , je fais de la modélisation moléculaire (mostly #AlphaFold) et simulations principalement sur des protéines virales des virus des hépatites E et C ☺️
Je m'éclate aussi de temps en temps avec #Blender 😋

18.11.2024 10:07 — 👍 13    🔁 3    💬 0    📌 0

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